MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 plasmid pMIC7113.03

Total Repeats: 379

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019740	GTTAAT	2	12	84	95	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019740	TAGA	2	8	104	111	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019740	AGAGG	2	10	143	152	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019740	AGT	2	6	207	212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019740	CGAGA	2	10	736	745	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_019740	TAC	2	6	918	923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_019740	A	6	6	1521	1526	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019740	TAA	2	6	1578	1583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019740	ACT	2	6	1611	1616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_019740	TG	3	6	1674	1679	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019740	AAT	2	6	2647	2652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019740	GA	4	8	2719	2726	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019740	GAA	2	6	3001	3006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019740	CAG	2	6	3010	3015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_019740	AGAA	2	8	3029	3036	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019740	AG	3	6	4156	4161	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019740	TGCTT	2	10	4267	4276	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_019740	TTGC	2	8	4286	4293	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_019740	CTTGA	2	10	7949	7958	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_019740	ATTG	2	8	7979	7986	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019740	GTC	2	6	8024	8029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_019740	ATTCAC	2	12	8089	8100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_019740	GT	3	6	8118	8123	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019740	CTGA	2	8	8187	8194	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_019740	ACCCT	2	10	8230	8239	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
26	NC_019740	G	8	8	8282	8289	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019740	G	7	7	8374	8380	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019740	A	6	6	8387	8392	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019740	C	7	7	8416	8422	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
30	NC_019740	GCT	2	6	8431	8436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_019740	TTAAG	2	10	8445	8454	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019740	AATG	2	8	8459	8466	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019740	AAAT	2	8	8487	8494	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019740	ACTCA	2	10	8619	8628	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
35	NC_019740	AAT	2	6	8645	8650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019740	CCT	2	6	8723	8728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_019740	A	6	6	8736	8741	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019740	ACA	2	6	8784	8789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_019740	AGG	2	6	10866	10871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019740	CGAGTT	2	12	10876	10887	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_019740	GGGGTA	2	12	10895	10906	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019740	GA	3	6	11026	11031	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019740	C	7	7	11092	11098	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
44	NC_019740	CT	3	6	11105	11110	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_019740	C	7	7	11183	11189	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
46	NC_019740	CT	3	6	11208	11213	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_019740	ATA	2	6	11355	11360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019740	CTTT	2	8	11509	11516	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_019740	GTG	2	6	11566	11571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019740	ACA	2	6	11887	11892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_019740	TACTCA	3	18	11899	11916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_019740	T	6	6	12993	12998	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019740	CTT	2	6	13022	13027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_019740	TTG	2	6	13323	13328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019740	TCT	2	6	13354	13359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_019740	C	6	6	13364	13369	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
57	NC_019740	CCT	2	6	13373	13378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_019740	G	6	6	13402	13407	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019740	AG	6	12	13411	13422	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019740	TTG	2	6	13423	13428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019740	TAAC	2	8	13434	13441	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_019740	ATT	2	6	14014	14019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019740	CCAAT	2	10	14055	14064	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
64	NC_019740	T	6	6	14431	14436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019740	TTAGGT	2	12	14505	14516	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019740	CCA	2	6	15135	15140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_019740	GTTAG	2	10	15194	15203	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019740	G	7	7	15306	15312	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019740	C	7	7	15347	15353	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
70	NC_019740	GA	3	6	15387	15392	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019740	TATT	2	8	15395	15402	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019740	C	8	8	15437	15444	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
73	NC_019740	TC	3	6	15464	15469	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_019740	CT	3	6	15538	15543	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_019740	CTT	2	6	15693	15698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_019740	CAA	2	6	15832	15837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_019740	ACTA	2	8	15905	15912	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_019740	TTC	2	6	16056	16061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_019740	ATA	2	6	16070	16075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019740	A	6	6	16298	16303	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019740	GTTG	2	8	16332	16339	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019740	CAC	2	6	16400	16405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_019740	ATTT	2	8	18446	18453	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019740	TGA	2	6	18466	18471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019740	CAG	2	6	18547	18552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_019740	TA	3	6	23881	23886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019740	CCT	2	6	25038	25043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_019740	GTA	2	6	25055	25060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019740	GGT	2	6	29850	29855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019740	TCA	2	6	29862	29867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_019740	TGC	2	6	29890	29895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_019740	CTAC	2	8	29911	29918	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_019740	TGT	2	6	29973	29978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019740	GAA	2	6	30005	30010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019740	TAAG	2	8	30054	30061	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019740	CTA	2	6	30067	30072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_019740	CTA	2	6	30075	30080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_019740	GTG	2	6	30192	30197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019740	GTAT	2	8	30226	30233	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019740	CTGG	2	8	30269	30276	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_019740	GTC	2	6	30286	30291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_019740	GTTG	2	8	30365	30372	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019740	TGT	2	6	30392	30397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019740	GTA	2	6	30466	30471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019740	GGA	2	6	30515	30520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019740	TCC	2	6	30534	30539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_019740	GAA	2	6	30692	30697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019740	TCC	2	6	30788	30793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_019740	TGC	2	6	30797	30802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_019740	A	6	6	30808	30813	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019740	GTA	2	6	33249	33254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019740	AAT	2	6	33300	33305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019740	GGA	2	6	33309	33314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019740	TTTG	2	8	33329	33336	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019740	AAC	2	6	33356	33361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_019740	ATT	2	6	33490	33495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019740	CAA	2	6	33648	33653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_019740	TGA	2	6	33677	33682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019740	ACA	2	6	33719	33724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_019740	GCC	2	6	33832	33837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_019740	TGCC	2	8	33920	33927	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_019740	AGC	2	6	33958	33963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_019740	GCT	2	6	34151	34156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_019740	CCA	2	6	34215	34220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_019740	TAA	2	6	34265	34270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019740	A	6	6	34269	34274	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019740	CGT	2	6	34293	34298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_019740	TAA	2	6	35572	35577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019740	CAC	2	6	35639	35644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_019740	T	6	6	35668	35673	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019740	CT	3	6	36033	36038	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_019740	GA	3	6	36047	36052	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019740	GA	3	6	36059	36064	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019740	CGAG	2	8	36085	36092	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_019740	A	7	7	37950	37956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019740	TTA	2	6	38985	38990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019740	AGGG	2	8	38992	38999	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019740	AGTT	2	8	39000	39007	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019740	G	6	6	39022	39027	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019740	G	6	6	39033	39038	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019740	AGA	2	6	39095	39100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019740	CTC	2	6	39791	39796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_019740	TAG	2	6	39812	39817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_019740	AAT	2	6	39866	39871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_019740	AGGA	2	8	39905	39912	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_019740	AGC	2	6	40144	40149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_019740	T	6	6	40158	40163	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_019740	AAAT	2	8	40232	40239	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_019740	TAC	2	6	40386	40391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_019740	ATT	2	6	40425	40430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_019740	AACA	2	8	40501	40508	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_019740	GTT	2	6	43515	43520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_019740	TGT	2	6	43569	43574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_019740	TCC	2	6	44384	44389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
159	NC_019740	TCC	2	6	44420	44425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
160	NC_019740	TCC	2	6	44429	44434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
161	NC_019740	TCC	2	6	44456	44461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
162	NC_019740	TCC	2	6	44465	44470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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187	NC_019740	GAAA	2	8	46239	46246	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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194	NC_019740	GA	3	6	46565	46570	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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292	NC_019740	TAC	2	6	64997	65002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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294	NC_019740	AT	3	6	65106	65111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.